Beelzebub trata sobre el delincuente juvenil más fuerte, Oga Tatsumi, estudiante de primer año en el instituto Ishiyama, la escuela para delincuentes. Durante un ajuste de cuentas, Oga se encuentra "casualmente" con el hijo del demonio; al ser el peor delincuente (el más malvado y más fuerte) es elegido para cuidar de él. Tratando de deshacerse del marrón que le ha caído encima, empieza a buscar por todo el instituto a alguien peor que él que se haga cargo del bebé, derrotando a todo aquel que se encuentra a su paso y destruyendo el instituto en el camino