Nel 26° secolo, mentre la galassia si lecca ferite di una guerra durata cento anni tra la Federazione Terrestre e la Federazione Selene, un gruppo di ragazzi trova nel relitto di un’astronave un data disk contenente i progetti della Yamato, l’ammiraglia della flotta terrestre abbattuta diciassette anni prima. Grazie ai macchinari di un cantiere navale automatizzato riusciranno a ricostruirla e ad imbarcarsi per una avventura ancora più grande di quel che pensavano.