В 2006 году люди на Земле подвергаются воздействию опасного вируса «Элджернона», затрагивающего процесс эволюции человека, вызывая мутации головного мозга с изменениями в центральной нервной системе. Те, кто поражён неизвестной заразой, приходят в ярость, становятся враждебными и склонными к самоубийству. Научно-исследовательская группа Akamatsu Industries, призванная противодействовать «Элджернону», во главе с доктором Мияко Асами руководит секретным подразделением нейроноидов, роботов в виде больших двухместных скафандров для работы в экстремальных условиях. Интерес учёных и пилотов вызывает таинственная сущность, известная как Беттермен. Школьник Кэйта Аоно после встречи с Хиноки Сай попадает в круговорот событий, где научные загадки, мистика и откровения приводят к драматичной развязке.