Bakumatsu to era, w której dusze młodych mężczyzn płonęły z obawy o przyszłość kraju. Takasugi Shinsaku, najemnik z Choshu, zakrada się na pokład statku rządowego ze swoim towarzyszem Katsurą Kogorou w poszukiwaniu tajemniczego „zegarka” z możliwością manipulowania czasem, którego obawia się, że rząd chce zachować dla siebie. Bardziej niż pozwolić, by taka moc trafiła w niepowołane ręce, Takasugi planuje zniszczyć artefakt, jednak jak tylko go zdobył, artefakt szybko został skradziony, co zmusza tych dwóch do pogoni za tajemniczym złodziejem do siedziby władz w Kioto. Jednakże, jak tylko przybywają do stolicy, dowiadują się, że rząd został obalony, a władzę przejęło bóstwo imieniem Susanoo. Ulice miasta i ludzie, którzy nimi chodzą, są zupełnie inni, niż Takasugi i Katsura pamiętali. Może i czasy się zmieniły, ale ich misja nie - Takasugi i Katsura postanawiają zresetować czas i uratować kraj od nikczemnych sił, które próbują go przejąć.