Anime opowiada o świcie przyszłości, który został zdominowany przez rozszerzoną rzeczywistość. Pewnego dnia Crane znajduje pod klifem ranną dziewczynę o imieniu Phryne. Wkrótce z niewyjaśnionych przyczyn nieznajoma znika, pozostawiając po sobie tylko swój wisiorek. Chłopak wyrusza w podróż razem z dziewczyną-avatarem Nessą, aby odnaleźć Phryne oraz odkryć sekret tajemniczego Systemu Fraktali.