Nel XXI secolo, l'esistenza degli Umanimali è stata svelata al mondo dopo secoli di oscurità. Michiru Kagemori è una normale liceale che un giorno si trasforma improvvisamente in una ragazza-tanuki. Inseguita dalla discriminazione degli umani, Michiru trova rifugio ad Anima City, una città-oasi creata per gli Umanimali: qui, insieme allo schivo e potente lupo Shirou Ogami, cercherà di scoprire l'origine della sua misteriosa mutazione.