C'est l'histoire de deux frères, Greg et Wirt, qui se retrouvent perdus, à la dérive du temps dans une étrange forêt appelée l'Inconnu. Espérant trouver le chemin du retour, Wirt et Greg sont forcés d'errer dans ce lieu étrange, aidés par un ancien bûcheron sage et Béatrice, un petit oiseau bleu.