Kamisaka Haruhi wird in Kindheitstagen von einem Jungen in ihrem Alter vor den Schikanen einer Gruppe Jungs gerettet. Dieser Junge benutzte Magie, um sie aus der Notsituation zu retten. Jahre später: Magie ist etwas Alltägliches, was sogar in den Schulen gelehrt werden kann. Die Schulen sind geteilt in sogenannte "Magierbereiche" und "Normalbereiche". Kamisaka Haruhi hat das Magiestudium nicht nur angefangen, vielmehr ist sie auch noch als Genie bekannt und wird als Schulschönheit gehandelt.